Les loci
En génétique, un locus (des loci au pluriel) est l'emplacement physique précis et invariable sur un chromosome. Il peut être l'emplacement d'un gène mais pas nécessairement. Les rats ont 21 paires de chromosomes. Voici quelques-uns des loci et leur emplacement sur chaque chromosome.
Chromosome 1
fz – fuzz récessif, le poil se développe normalement puis des zones deviennent nues.
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- LG – Grineberg's lethal (en anglais) = regroupe différents gènes létaux cause de nombreuses maladies différentes.
LG – gène récessif létal de Greenberg, il est létal s'il est lié à c. Les homozygotes semblent normaux à la naissance mais la croissance est retardée et la tête est anormalement grosse par rapport au reste du corps. Ceux qui vivent assez longtemps pour que les dents poussent souffrent de malocclusion (pousse anormale des dents). La plupart sont bossus et leur cage thoracique est déformée, limitant l'espace accueillant les poumons et la respiration doit être abdominale au lieu de se faire dans la poitrine. A cause des ces malformations, il est possible qu'ils ne puissent pas éternuer si le nez est bouché forçant le rat à respirer par la bouche. Ils peuvent aussi souffrir d'emphysème (destruction des voies aériennes distales), le cœur est donc situé directement entre les côtes et les poumons au lieu d'être partiellement enveloppé par des nervures chez un rat sain. Les ratons atteints ne dépassent généralement pas la deuxième semaine de vie. Les causes de décès varient mais sont généralement les suivantes : lente suffocation, coma, hypertrophie cardiaque, hémorragie, malocclusion, problèmes d'alimentation, sous-nutrition, narines bouchées.
- p – PED, yeux roses = responsable de la dilution des yeux roses
p – pink eyed dilution, dilue le noir en champagne et les agouti en ambre.
- r – RED, yeux rouges = responsable de la dilution des yeux rouges
r – red eyed dilution, dilue le noir en beige et l'agouti en topaze.
- Tal – taillessness, anomalie de la queue = manx
tal – type sauvage, récessif, sans effet.
- C – couleur = albinos, absence de pigments de mélanine
c(h) – himalayen, lorsqu'il est homozygote, les rats sont beiges très clairs avant leur première mue, puis les oreilles, le nez, la queue et la base de la queue deviennent foncés.
c(d) – dilution ruby, récessif, les homozygotes agouti sont dépourvus de pigments jaunes, les poils noirs sont donc plus clairs.
c – albinos, récessif, les homozygotes sont blancs aux yeux roses et ont une vision très médiocres en raison de l'absence de pigments rétiniens.
- w – Waltzing = gène responsable d'un trait de comportement anormal
Chromosome 2
Chromosome 3
- A – Agouti
A – type sauvage, dominant, le rat a des poils noirs composés d'une bande jaune, le ventre est légèrement plus clair et argenté que le reste du corps.
a – récessif, non-agouti, si aucun modificateur n'est présent, l'homozygote donne un rat noir.
- F – Fawn
f – récessif, les rats af sont café, les df sont lavande.
- Pe – Pearl
- Wt1 – Tumeur de Wilms = tumeur du rein chez l'enfant
- Zi – Zitter
zi – récessif, cause l'épilepsie et l'encéphalopathie spongiforme du système nerveux central (syndrome de la vache folle chez les bovins).
- EDN3 – lethal spotting (gène létal des tâches), récessif, mégacôlon
- S1 – type sauvage, dominant, sans effet
- m – Mink
m – récessif, en homozygote sur une base noir il donne du mink, sur une base agouti il donne du cannelle.
Chromosome 4
- lep – Obésité
- rl – Reeler
rl – Reeler, hypoplasie (arrêt du développement ou développement insuffisant du tissu d'un organe).
- k – Kiny
k – kinky, rex récessif, le poil est très court.
- st – Stubby = manx
st – récessif, queue tronquée, cette mutation affecte la longueur de la queue, elle est létale sous sa forme homozygote.
Chromosome 5
- une – Anémie
- Cu1 – Curly1
cu1 – type sauvage, récessif, sans effet.
- Hd – Hypodactylie (absence de plusieurs doigts ou orteils)
hd – hypodactylie, récessif, les rats touchés ont moins de doigts, généralement aux pattes arrières et les mâles sont stériles.
- en - « incisorless » (absence de dents), lié à Hypodactylie
en – « incisorless », récessif, les rats touchés n'ont pas de dents, ils ont tendance à grandir plus lentement que les membres de la fratrie non atteints.
- JE – surdité, lié à Brown
JE – surdité, récessif, les rats touchés sont sourds.
- sm – smoke
sm – smoke, récessif, la base des poils est de couleur blanche ou crème.
- Lepr (cp) – récepteur de la léptine
LEPR (cp) – obésité, récessif, les rats touchés sont en surpoids et développent souvent du diabète, ils pèsent à l'âge adulte entre 800 et 1000g.
- SH – Shaggy, lié à Curly1
sh – type sauvage, sans effet.
- b – Brown
b – brown, récessif, les homozygotes non-agouti sont chocolat, les homozygotes agouti sont cannelle.
Chromosome 6
Chromosome 7
Chromosome 8
- d – bleu russe
d – bleu russe, récessif.
D(L) – bleu russe, mutation létale récessive, cause l'ataxie et la dilution de la couleur de la robe, les rats atteints développent de graves troubles neuromusculaires y compris des convulsions.
Chromosome 9
Chromosome 10
- Brcal – tumeur mammaire (cancer du sein)
- rnu – Rowlett Nude
rnu – Rowlett Nude, immunité déprimée et absence de thymus, les femelles ont généralement des problèmes de lactation.
- Rc – carcinome rénal (cancer du rein)
- tm – tremblement
t1 – tremblement, récessif, se caractérise par une incoordination des membres antérieurs et postérieurs.
Chromosome 11
Chromosome 12
- Brca2 – tumeur mammaire 2 (cancer du sein 2)
Chromosome 13
Chromosome 14
- H – Hood, lié à hm
H(e) – allèle dominant, les hétérozygotes ressemblent à H(re), en homozygote il donne des BEW et des patchés.
H – type sauvage, allèle dominant, en homozygote il donne des unis, en hétérozygote, il donne des berkshire.
h(i) – récessif, donne des fléchés.
h(n) - les homozygotes sont capés, aucun effet en hétérozygote.
h – capuche, en homozygote il donne du bareback, aucun effet en hétérozygote.
- Hm – Capuche
Hm(s) – a pour effet de créer une bande plus ou moins inexistante sur des rats capés et bareback.
Chromosome 15
Chromosome 16
Chromosome 17
- End1 – Endothéline , neuropeptide ayant un effet vasoconstricteur sur les cellules musculaires lisses
Chromosome 18
Chromosome 19
Chromosome 20
Chromosome X
- FMR1 – « Fragile X Mental Retardation », cause l'autisme et est la cause héréditaire la plus fréquente de retard mental chez les garçons.
Références
Oocities: "Rat Loci by Chromosome"
La source dont provient cet article est assez ancienne et ne semble pas avoir été mise à jour récemment, il est donc possible que certaines des informations ci-dessus ne soient plus exactes.
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