Lire un code génétique
Vous connaissez toutes les bases de la génétique, vous avez absolument tout compris sur la génétique d'aspect et maintenant une nouvelle difficulté se présente à vous : que veulent dire ces successions de lettres et de tirets ?! Elles représentent le code génétique aussi appelé génotype. Un génotype peut par exemple ressembler à ça : A/- B/- C/- D/- G/- M/- P/- pe/pe Sd/- , et tout cela signifie pour résumer que votre rat est agouti !
Dans un code génétique, les lettres vont par paires, tout comme les deux exemplaires d'un gène. Les différentes paires de lettres représentent donc les différents gènes connus qui codent pour ce type. La composition du code donne ainsi les éléments qui indiquent finalement de quelle couleur est le rat, mais elle indique aussi si votre rat est porteur d'un autre gène qui ne se voit pas, car comme vous le savez, certains gènes qui ne s'expriment pas entrent dans la composition d'une couleur.
Maintenant il faut savoir le décoder ce code ! Et bien c'est simple, il suffit de connaître les règles de la notation qui sont :
Dans un code génétique, les lettres vont par paires, tout comme les deux exemplaires d'un gène. Les différentes paires de lettres représentent donc les différents gènes connus qui codent pour ce type. La composition du code donne ainsi les éléments qui indiquent finalement de quelle couleur est le rat, mais elle indique aussi si votre rat est porteur d'un autre gène qui ne se voit pas, car comme vous le savez, certains gènes qui ne s'expriment pas entrent dans la composition d'une couleur.
Maintenant il faut savoir le décoder ce code ! Et bien c'est simple, il suffit de connaître les règles de la notation qui sont :
- les gènes dominants se notent en MAJUSCULE
- les gènes récessifs se notent en minuscule
- si l'on ne connaît pas (inconnu) l'un des deux gènes de la paire on note un tiret (-)
En gros, si vous avez un rat agouti ou d'une couleur de base agoutie, la première lettre de sa paire est obligatoirement A. Si les parents sont inconnus alors vous mettez un tiret ce qui donne A/-. Si l'un des deux parents est noir, alors votre rat a obligatoirement un gène noir qui se note a, car il est récessif, ce qui donne A/a. Et bien entendu cela fonctionne avec toutes les autres couleurs possibles, il suffit maintenant de connaître les lettres qui correspondent aux couleurs !
La notation du code génétique ne comprend pas tous les gènes qui peuvent agir sur l'aspect de votre rat. Dans l'exemple donné ci-dessus, rien ne vient indiquer quoi que ce soit sur le marquage, le type d'oreilles ou de poils. Les codes génétiques sont réellement importants chez le rat lorsque l'on se concentre sur les couleurs car elles sont nombreuses, et les possibilités le sont tout autant.
Si vous avez bien suivi l'article la génétique d'aspect, et bien sachez que ce code génétique est en réalité l'équivalent des points de couleur. Donc si vous suivez toujours, si par exemple mon rat est A/a, alors il va transmettre à ses petits soit A soit a. Une fois que cette notion est saisie, vous comprenez certainement pourquoi les tableaux peuvent rapidement devenir complexes mais sachez que vous aurez rarement à vous soucier de toutes les lettres.
Par exemple, si vous voulez obtenir la couleur cannelle dont le code est A/- m/m. Pour faire votre petite cuisine, il vous faut au moins des parents A/- -/m et -/- -/m. Vous avez réfléchi tout seul et vous avez donc bien compris que cela signifie qu'il vous faut un parent qui apporte le gène agouti, et que les deux impérativement doivent apporter le mink (que le gène mink soit exprimé ou qu'il soit juste porté, la différence est que s'il n'est que porté, vous aurez moins de petits cannelle !)
Si vous avez bien suivi l'article la génétique d'aspect, et bien sachez que ce code génétique est en réalité l'équivalent des points de couleur. Donc si vous suivez toujours, si par exemple mon rat est A/a, alors il va transmettre à ses petits soit A soit a. Une fois que cette notion est saisie, vous comprenez certainement pourquoi les tableaux peuvent rapidement devenir complexes mais sachez que vous aurez rarement à vous soucier de toutes les lettres.
Par exemple, si vous voulez obtenir la couleur cannelle dont le code est A/- m/m. Pour faire votre petite cuisine, il vous faut au moins des parents A/- -/m et -/- -/m. Vous avez réfléchi tout seul et vous avez donc bien compris que cela signifie qu'il vous faut un parent qui apporte le gène agouti, et que les deux impérativement doivent apporter le mink (que le gène mink soit exprimé ou qu'il soit juste porté, la différence est que s'il n'est que porté, vous aurez moins de petits cannelle !)
Couleurs de base, composées et dilutions
Si vous vous lancez dans des calculs, que vous vous mettez en quête du code que vous recherchez depuis des mois, vous tomberez sûrement sur d'autres notions importantes à connaître.
- Couleurs de base : chez le rat, les mutations se font à partir d'un gène existant et s'expriment en fonction des gènes majeurs déjà en place. On dit qu'une couleur est de "base noire" quand le rat doit avoir a/a dans son code pour que l'on voit la couleur sous sa forme première. Une couleur de base noire qui va se trouver en présence d'agouti A/-, soit ne se verra pas, soit apparaîtra sous une autre forme. Par exemple, le mink est une couleur de base noire, pour obtenir le mink il faut que sa première paire soit a/a. Si la première paire est A/- alors vous n'obtiendrez pas du mink, mais du cannelle, qui est une couleur de base agoutie.
- Couleurs composées : les deux bases des couleurs du rat sont le noir et l'agouti. Quand une couleur est de base agoutie, les poils ont plusieurs couleurs, ils sont panachés, comme le sont les poils de l'agouti et le ventre est plus clair. Si la couleur est de base noire, les poils vont être plus uniformes, et la couleur du ventre sera de même. Pour simplifier ce qu'il faut retenir c'est que :
couleur composée = couleur de base agoutiE
couleur simple = couleur de base noirE
- Dilutions : plus complexes que les couleurs, c'est en version simplifiée le gène dont la présence va modifier la couleur qu'il dilue. C'est le cas par exemple pour le siamois (ou toutes les autres dilutions). Les dilutions donnent des résultats différents selon la couleur qu'elles diluent, c'est pourquoi dans le cas du siamois, on indique la couleur qui a subi la dilution (seal point pour les siamois de base agoutie ou noire, blue point pour les siamois de base bleue, mink point pour les siamois de base mink....).
Mise en pratique
Cette fois ça y est, vous êtes vraiment totalement prêt(e) à vous lancer ! Et bien pour vous accompagner complètement, vous savez ce que nous allons faire ? Nous allons mettre toutes vos connaissances en pratique et faire un exercice qui vous aidera peut-être à comprendre quelques petits détails qui vous semblaient encore indécis. Jouez le jeu, munissez-vous d'une feuille de papier et d'un crayon, et mettons-nous en route vers l'accomplissement de vos heures de bachotage ! L'enjeu de cet exercice sera bien entendu de trouver ce que cette portée va nous donner.
♡ Contexte:
♡ Rappels:
♡ Contexte:
- Ratouilloux est un mâle siamois seal point, son père est bleu US et sa mère est noire
- Ratouillette est une femelle bleu agouti, son père est siamois et sa mère est bleu US
♡ Rappels:
Le gène agouti présente 2 allèles :
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Le gène albinos présente 3 allèles :
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Le gène bleu présente 2 allèles :
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♡ Étude du génotype de Ratouilloux:
Son génotype est donc a/a D/d ch/ch
♡ Étude du génotype de Ratouillette:
Son génotype est donc A/a d/d C/ch
♡ Les gamètes
Il est maintenant possible de déterminer les différents types de gamètes de notre couple d'amoureux, puisque nous savons que chacun va transmettre au hasard un seul gène de chacune de ses paires à chacun de ses enfant.
Ratouilloux est donc a/a D/d ch/ch: pour le gène agouti il ne peut transmettre que le a, pour le gène bleu il peut transmettre soit D soit d, et pour le gène albinos il ne peut transmettre que ch. Il va donc avoir 2 types de spermatozoïdes:
- Il est siamois, donc on sait qu'il est obligatoirement homozygote siamois soit ch/ch (car l'allèle siamois est récessif, il a donc besoin d'être présent en double pour s'exprimer).
- Son papa est bleu US et sa maman noire. Donc il est de base noire, comme ses parents, soit a/a (le bleu et le noir sont des couleurs de base noire, ils ont donc transmis le gène noir en double).
- Étant donné que papa est bleu US, il a donc forcément transmis également l'un de ses gènes bleu. Mais Ratouilloux n'est pas siamois blue point puisque sa mère ne lui a pas transmis l'autre gène bleu. Il est donc porteur bleu US soit D/d (porteur bleu).
Son génotype est donc a/a D/d ch/ch
♡ Étude du génotype de Ratouillette:
- Elle est bleu agouti, donc on sait qu'elle est obligatoirement homozygote bleu soit d/d (car l'allèle bleu est récessif, il a donc besoin d'être présent en double pour s'exprimer), mais comme elle n'est pas simplement bleue, on sait aussi qu'elle porte au moins un gène agouti.
- Son papa est siamois donc elle a forcément hérité d'un allèle ch de son père, mais elle n'est pas siamois donc obligatoirement C/ch (porteur siamois).
- Sa maman est bleu US, elle a donc forcément transmis un gène bleu à Ratouillette, mais elle lui a également transmis un allèle noir, puisqu'elle est de base noire. Mais Ratouillette n'est pas de base noire puisqu'elle est bleu agouti, son père lui a donc forcément transmis un gène agouti. Son génotype pour le gène agouti est donc A/a (agouti porteur noir, on peut également conclure que le père est siamois seal point, de base agoutie).
- Ratouillette est bleu agouti, donc elle possède 2 allèles bleu d/d, le premier lui venant de sa mère qui est bleu US. Le second lui vient donc forcément de son père qui est lui-même porteur bleu.
Son génotype est donc A/a d/d C/ch
♡ Les gamètes
Il est maintenant possible de déterminer les différents types de gamètes de notre couple d'amoureux, puisque nous savons que chacun va transmettre au hasard un seul gène de chacune de ses paires à chacun de ses enfant.
Ratouilloux est donc a/a D/d ch/ch: pour le gène agouti il ne peut transmettre que le a, pour le gène bleu il peut transmettre soit D soit d, et pour le gène albinos il ne peut transmettre que ch. Il va donc avoir 2 types de spermatozoïdes:
- a D ch
- a d ch
- A d C
- A d ch
- a d C
- a d ch
Nous sommes désormais en mesure d'effectuer les différentes combinaisons des gamètes. La spermatozoïde 1 peut rencontrer 4 ovules différents, et le spermatozoïde 2 peut rencontrer lui aussi ces 4 ovules différents : nous avons donc 8 possibilités, donc la probabilité de chacune d'entre elles est de 1/8 soit 12.5%.
Ce qui nous donne au final :
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♡ L'utilisation de la table de Punnett:
Il est parfois difficile de gérer tous les gènes en même temps, dans ce cas il est plus simple de faire le contraire : gérer les gènes un par un et tout recombiner ensuite. Pour cela on utilise la table de Punnett, une méthode simple qui vous permet de calculer rapidement tous les cas de figure pour un gène simple. On prend les gènes de papa, les gènes de maman, on les range dans des colonnes et des lignes, et dans les cases vides on va écrire la combinaison (pour simplifier la compréhension, les gènes de maman sont roses, ceux de papa sont bleus).
Il est parfois difficile de gérer tous les gènes en même temps, dans ce cas il est plus simple de faire le contraire : gérer les gènes un par un et tout recombiner ensuite. Pour cela on utilise la table de Punnett, une méthode simple qui vous permet de calculer rapidement tous les cas de figure pour un gène simple. On prend les gènes de papa, les gènes de maman, on les range dans des colonnes et des lignes, et dans les cases vides on va écrire la combinaison (pour simplifier la compréhension, les gènes de maman sont roses, ceux de papa sont bleus).
50% agouti porteurs noirs et 50% noir
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50% bleu et 50% porteurs bleu
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50% siamois et 50% porteurs siamois
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Cela nous donne donc 50% agoutis porteurs noirs, la moitié de ces 50% (1/4 soit 25%) est également bleue et l'autre porteuse bleue. Nous avons également 50% de noirs, dont la moitié (1/4 soit 25%) est aussi bleue et l'autre porteuse bleue. Ce qui fait :
- 1/4 agouti porteur bleu
- 1/4 bleu agouti
- 1/4 noir porteur bleu
- 1/4 bleu
- 12.5% siamois base agouti porteur bleu
- 12.5% agouti porteur bleu et siamois
- 12.5% siamois bleu agouti
- 12.5% bleu agouti porteur siamois
- 12.5% siamois base noir porteur bleu
- 12.5% noir porteur siamois et bleu
- 12.5% siamois bleu
- 12.5% bleu porteur siamois